Aparatura Zakładu Biologii i Obrazowania Komórki
Niestandardowa aparatura
- ESCO CelCulture CO2/O2 inkubator (ESCO, USA) Inkubator do hodowli komórek in vitro z funkcją hipoksji – kontroluje temperaturę, wilgotność, poziom dwutlenku węgla od 0% do 20% oraz stężenie tlenu od 1% do 20,7% oraz wilgotność do 97%; umożliwia prace eksperymentalne w hodowli in vitro w zakresie biologii komórki, mikrobiologii i biologii molekularnej; zastosowanie obejmuje też inżynierię tkankową, zapłodnienie in vitro, neurobiologię, badania nad rakiem i inne
- a) ogólne warunki wykorzystania - na zasadzie współpracy po uzgodnieniu trybu i czasu wykorzystania
- b) lokalizacja sprzętu i osoba do kontaktu: Zakład Biologii i Obrazowania Komórki, laboratorium hodowli komórkowych, dr hab. Grzegorz Tylko, prof. UJ; grzegorz.tylko@uj.edu.pl
- Inkubator stacjonarny, dwugazowy CO2/O2 do hodowli komórkowych w warunkach hipoksji (od 0.1% do 21% stężenia O2), model Galaxy 48R firmy New Brunswick Company.
- a) ogólne warunki wykorzystania - na zasadzie współpracy po uzgodnieniu trybu i czasu wykorzystania
- b) lokalizacja sprzętu i osoba do kontaktu: Zakład Biologii i Obrazowania Komórki, laboratorium hodowli komórkowych, dr hab. Marek Romek, prof. UJ; marek.romek@uj.edu.pl
- CytoSMART LUX2 (Niderlandy) - rejestracje obrazów kultur komórkowych w określonym przedziale czasu od minuty do tygodni; automatyczne powiadomienia, graficzne przedstawienie danych dotyczące podziału komórek, monitorowania wzrostu i konfluencji hodowli, umożliwia śledzenie przestrzenne i czasowe podziałów i wzrostu komórek, tworzenie kolonii, migracji, chemotaksji itp.; więcej informacji
- a) ogólne warunki wykorzystania - na zasadzie współpracy po uzgodnieniu trybu i czasu wykorzystania, dostęp do kalendarza urządzenia on-line po uprzednim zgłoszeniu
- b) lokalizacja sprzętu i osoba do kontaktu (dane kontaktowe): Zakład Biologii i Obrazowania Komórki, laboratorium hodowli komórkowych, dr hab. Grzegorz Tylko, prof. UJ, grzegorz.tylko@uj.edu.pl
- LUX3TM FL (Axion BioSystems) - rejestracje obrazów kultur komórkowych w określonym przedziale czasu od minuty do tygodni; automatyczne powiadomienia, graficzne przedstawienie danych dotyczące podziału komórek, monitorowania wzrostu i konfluencji hodowli, umożliwia śledzenie przestrzenne i czasowe podziałów i wzrostu komórek, tworzenie kolonii, migracji, chemotaksji itp. Dwa urządzenia w wersji fluorescencyjnej z możliwością obserwacji komórek transfekowanych fluorochromami w zakresie emisji zieleni i czerwieni; więcej informacji
- a) ogólne warunki wykorzystania - na zasadzie współpracy po uzgodnieniu trybu i czasu wykorzystania, dostęp do kalendarza urządzenia on-line po uprzednim zgłoszeniu.
- b) lokalizacja sprzętu i osoba do kontaktu (dane kontaktowe): Zakład Biologii i Obrazowania Komórki, laboratorium hodowli komórkowych, dr hab. Grzegorz Tylko, prof. UJ, grzegorz.tylko@uj.edu.pl
- EBERS TEB-1000 Bioreactor (EBERS, Spain) – Inkubator do hodowli komórek z wbudowanymi 2-ma pompami perfuzyjnymi umożliwiającymi prowadzenie kontrolowanego, jedno- lub dwukierunkowego przepływu płynów w układzie zamkniętym w 2- i 3-wymiarowych hodowlach komórek; więcej informacji
- a) ogólne warunki wykorzystania - Na zasadzie współpracy po uzgodnieniu trybu i czasu wykorzystania
- b) lokalizacja sprzętu i osoba do kontaktu (dane kontaktowe): Zakład Biologii i Obrazowania Komórki, laboratorium hodowli komórkowych, Prof. Dr hab. Anna M. Osyczka, anna.osyczka@uj.edu.pl
- 4D-Nucleofector Y Unit with Core Unit (Lonza) – umożliwia elektroporację (wprowadzanie DNA, RNA i powiązanych produktów do cytoplazmy i jądra komórkowego) komórek adherentnych; zob. też
- a) ogólne warunki wykorzystania - Na zasadzie współpracy po uzgodnieniu trybu i czasu wykorzystania
- b) lokalizacja sprzętu i osoba do kontaktu (dane kontaktowe): Zakład Biologii i Obrazowania Komórki, laboratorium hodowli komórkowych, Prof. Dr hab. Anna M. Osyczka, anna.osyczka@uj.edu.pl
- Drosophila melanogaster culture facility – Profesjonalna zwierzętarnia z hodowlą D. melanogaster, płytki do usypiania i screeningu fenotypu, mikroskop stereoskopowy fluorescencyjny – screening na obecność GFP, szereg dostępnych szczepów transgenicznych i mutantów
- a) ogólne warunki wykorzystania - Na zasadzie współpracy po uzgodnieniu trybu i czasu wykorzystania
- b) lokalizacja sprzętu i osoba do kontaktu (dane kontaktowe) – Zakład Biologii i Obrazowania Komórki, laboratorium hodowli D. melanogaster, Dr hab. Milena Damulewicz, milena.damulewicz@uj.edu.pl, Dr Jolanta Górska-Andrzejak, j.gorska-andrzejak@uj.edu.pl
- System do analizy lokomotoryki owadów (DAMS) – Pomiar aktywności lokomotorycznej owadów, analiza snu przy różnych warunkach świetlnych i temperaturowych
- a) ogólne warunki wykorzystania - na zasadzie współpracy/do uzgodnienia
- b) lokalizacja sprzętu i osoba do kontaktu (dane kontaktowe) – Zakład Biologii i Obrazowania Komórki, laboratorium hodowli D. melanogaster Dr hab. Milena Damulewicz, milena.damulewicz@uj.edu.pl, Dr Jolanta Górska-Andrzejak, j.gorska-andrzejak@uj.edu.pl
- Zeiss AxioImager.2 z przystawką Apotome 3 – pozwala na wykorzystanie techniki SIM (Structured Illumination Microscopy), dającej trójwymiarowy obraz tkanek i komórek analogiczny do obrazów uzyskiwanych w mikroskopach konfokalnych.
- a) ogólne warunki wykorzystania - na zasadzie współpracy/do uzgodnienia
- b) lokalizacja sprzętu i osoba do kontaktu (dane kontaktowe) – Zakład Biologii i Obrazowania Komórki, laboratorium hodowli D. melanogaster, dr hab. Milena Damulewicz, milena.damulewicz@uj.edu.pl
- Pracownia mikroskopii elektronowej i konfokalnej – więcej informacji
- Wirówka laboratoryjna ROTOFIX 32A Hettich
- a) ogólne warunki wykorzystania - na zasadzie współpracy/do uzgodnienia
- b) lokalizacja sprzętu i osoba do kontaktu (dane kontaktowe) – Zakład Biologii i Obrazowania Komórki, pracownia cytologii i histologii, dr hab. Janusz Karasiński, prof. UJ, janusz.karasinski@uj.edu.pl
Standardowa aparatura
- Zeiss Axiovert 40 CFL (Carl Zeiss, Niemcy) – rejestracje obrazów kultur komórkowych w jasnym polu, kontraście fazowym i fluorescencji w przedziale wzbudzania/emisji dla DAPI, FITC oraz rodaminy; kamera cyfrowa AxioCam 208 color (Zeiss, Niemcy) obsługiwana przez oprogramowanie ZEN
- a) ogólne warunki wykorzystania - na zasadzie współpracy po uzgodnieniu trybu i czasu wykorzystania
- b) lokalizacja sprzętu i osoba do kontaktu (dane kontaktowe): Zakład Biologii i Obrazowania Komórki, laboratorium hodowli komórkowych, dr hab. Grzegorz Tylko, prof. UJ, grzegorz.tylko@uj.edu.pl
- Zeiss Axiovert 5 TL FL SCB (Carl Zeiss, Niemcy) – rejestracje obrazów kultur komórkowych w jasnym polu, kontraście fazowym, kontraście interferencyjnym i fluorescencji w przedziale wzbudzania/emisji dla DAPI, FITC, CY3 i CY5; kamera cyfrowa AxioCam 208 color (Zeiss, Niemcy) obsługiwana przez oprogramowanie ZEN; atutem mikroskopu jest kontrast interferencyjny PlasDIC umożliwiający uzyskanie kontrastu komórek z hodowli in vitro hodowanych na podłożach plastikowych; zob. również
- a) ogólne warunki wykorzystania - na zasadzie współpracy po uzgodnieniu trybu i czasu wykorzystania
- b) lokalizacja sprzętu i osoba do kontaktu (dane kontaktowe): Zakład Biologii i Obrazowania Komórki, sala dydaktyczna 0.68, dr hab. Grzegorz Tylko, prof. UJ, grzegorz.tylko@uj.edu.pl
- Zeiss SteREO Discovery.V8 (Carl Zeiss, Niemcy) – stereomikroskop do preparacji tkanek zwierząt i roślin oraz rejestracji obrazów obiektów przestrzennych w szerokim polu widzenia; praca z materiałem w świetle przechodzącym, odbitym, w ciemnym polu oraz fluorescencji dla FITC i CY3; kamera cyfrowa AxioCam 208 color (Zeiss, Niemcy) obsługiwana przez oprogramowanie ZEN; więcej informacji
- a) ogólne warunki wykorzystania - na zasadzie współpracy po uzgodnieniu trybu i czasu wykorzystania
- b) lokalizacja sprzętu i osoba do kontaktu (dane kontaktowe): Zakład Biologii i Obrazowania Komórki, sala dydaktyczna 0.68, dr hab. Grzegorz Tylko, prof. UJ, grzegorz.tylko@uj.edu.pl
- Czytnik płytkowy SpectraMax iD3 Multi-Mode Microplate Reader – Odczyty w szerokim zakresie światła widzialnego, luminescencji i fluorescencji, tj. Abs: 230 - 1000 nm; FL Ex: 250 - 830 nm; FL Em: 270 - 850 nm; Lumi: 300 - 850 nm. Dodatkowe funkcje: mieszanie, skanowanie, odczyt kinetyczny (pomiary w czasie); więcej szczegółów
- a) ogólne warunki wykorzystania - Na zasadzie współpracy po uzgodnieniu trybu i czasu wykorzystania
- b) lokalizacja sprzętu i osoba do kontaktu (dane kontaktowe): Zakład Biologii i Obrazowania Komórki, laboratorium biochemiczne, Prof. Dr hab. Anna M. Osyczka, anna.osyczka@uj.edu.pl
- System wizualizacji żeli i membran Azure 600 – wizualizacja wyników elektroforezy na żelach i membranach – chemiluminescencja, fluorescencja, UV, podczerwień
- a) ogólne warunki wykorzystania - na zasadzie współpracy/do uzgodnienia
- b) lokalizacja sprzętu i osoba do kontaktu (dane kontaktowe) – Zakład Biologii i Obrazowania Komórki, laboratorium biochemiczne, Dr hab. Milena Damulewicz, milena.damulewicz@uj.edu.pl
- StepOne Real-Time PCR System (Applied Biosystems) – aparat do PCR w czasie rzeczywistym.
- a) ogólne warunki wykorzystania - Na zasadzie współpracy po uzgodnieniu trybu i czasu wykorzystania
- b) lokalizacja sprzętu i osoba do kontaktu (dane kontaktowe): Zakład Biologii i Obrazowania Komórki, laboratorium molekularne, Prof. Dr hab. Anna M. Osyczka, anna.osyczka@uj.edu.pl
- Termocykler z gradientem temperaturowym Sensoquest – aparat do standardowego PCR w gradiencie temperaturowym lub bez.
- a) ogólne warunki wykorzystania - na zasadzie współpracy/do uzgodnienia
- b) lokalizacja sprzętu i osoba do kontaktu (dane kontaktowe) – Zakład Biologii i Obrazowania Komórki, laboratorium molekularne, Dr hab. Milena Damulewicz, milena.damulewicz@uj.edu.pl
- Mikrotom do skrawków parafinowych (Jung Multicut 2045 Leica, Austria) – do cięcia skrawków histologicznych tkanek zwierzęcych i roślinnych zatopionych w parafinie; mikrotomowi towarzyszy łaźnia wodna (Water Bath 1002, Histolab Products, Goteborg, Sweden).
- a) ogólne warunki wykorzystania - na zasadzie współpracy po uzgodnieniu trybu i czasu wykorzystania,
- b) lokalizacja sprzętu i osoba do kontaktu (dane kontaktowe): Zakład Biologii i Obrazowania Komórki, laboratorium histologiczne, dr Jakub Dymek, kuba.dymek@uj.edu.pl